Kaori Sugimura (杉村 佳織)

Ph.D. student (博士後期課程3年)
Ochanomizu University
Mail: sugimura.kaori(at)is.ocha.ac.jp

• Research topics

  • Nonlinear Dynamics
  
  
  • Phase reduction of the model for planar cell polarity
  
  
  • Spatio-temporal pattern formation

• Publications

  1. Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
     “A reduced cell-based phase model for tissue polarity alignment through global anisotropic cues”
     Scientific Reports 7, 17466 (2017).
  
  
  2. Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
     “A Simple Generic Model of Cellular Polarity Alignment: Derivation and Analysis” (2016). [arXiv]
  
  
  3. Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
     “Exponential system-size dependence of the lifetime of transient spiral chaos in excitable and oscillatory media”
     Physical Review E 92, 062915 (2015). [arXiv]
  
  
  4. 杉村 佳織, 郡 宏
     "線形安定性解析によるスパイラルカオスの性質区別とdefect検出の実装方法"
     数理解析研究所講究録, No.1937, pp149-153 (2015)
  
  

• International Conferences and Workshops

  1. Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
     "Phase model for polarity ordering in spatially extended dynamical units: Derivation and dynamical properties"
     5th Winter Q-BIO meeting
     Grand Hyatt Kauai Resort and Spa, Kauai, Hawaii, 23 Feb., 2017 (poster).
  
  
  2. Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
     "Phase model for polarity ordering in spatially extended dynamical units: Derivation and dynamical properties"
     9th Dynamics Days Asia Pacific
     Hong Kong Baptist University, Hong Kong University of Science and Technology, Kowloon Tong, Hong Kong, 15 Dec., 2016 (oral).
  
  
  3. Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
     "Role of oscillation in periodic pattern formation in a noisy system"
     8th International Conference Engineering of Chemical Complexity
     IAS, Technische Universität München, Garching, München, Germany, 23 Jun., 2015 (poster).
  
  
  4. Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
     "System size dependence of spiral chaos in excitable media: lifetime and transition rate"
     International WE-Heraeus-Physics-School on Model systems for understanding biological processes, Bad Honnef, Germany, 26 Feb., 2015 (oral).
  
  
  5. Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
     "Exponential dependence of the lifetime of spiral chaos on system size"
     The 10th AIMS conference on dynamical systems, Universidad Autonoma de Madrid, Spain, 9 Jul., 2014 (oral).
  
  
  6. Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
     "Lifetime of spatiotemporal chaos and the atrial fibrillation"
     Spatiotemporal pattern formation in biological and active matters, Ochanomizu Univ., Tokyo, Japan, 2 Mar., 2013 (poster).
  
  

• Domestic Conferences and Workshops (in Japanese)

  1. 杉村 佳織, 郡 宏, 石原 秀至, 杉村 薫
     "実験データに基づく平面内細胞極性の細胞形状依存性の理論研究"
     日本物理学会秋季大会, 岩手大学上田キャンパス(岩手県盛岡市), 23 Sept., 2017 (oral).
  
  
  2. 杉村 佳織, 郡 宏
     "平面内細胞極性のダイナミクスの幾何的情報依存性"
     日本物理学会第72回年次大会, 大阪大学豊中キャンパス(大阪府豊中市), 17 Mar., 2017 (oral).
  
  
  3. 杉村 佳織, 郡 宏
     "平面内細胞極性のモデルの位相縮約理論"
     日本物理学会秋季大会, 金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市), 14 Sept., 2016 (oral).
  
  
  4. 杉村 佳織, 郡 宏
     "平面内細胞極性を再現するモデルの位相縮約理論の構築"
     CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域 第6回数理デザイン道場, 東レ(株)総合研修センター(静岡県三島市), 13 Jun., 2016 (poster).
  
  
  5. 杉村 佳織, 郡 宏
     "平面内細胞極性を示す数理モデルの構築"
     日本物理学会第71回年次大会, 東北学院大学泉キャンパス(宮城県仙台市), 20 Mar., 2016 (poster).
  
  
  6. 杉村 佳織, 郡 宏
     "遷移的スパイラルカオスの持続時間のシステムサイズ依存性"
     日本物理学会秋季大会, 関西大学千里山キャンパス(大阪府吹田市), 17 Sept., 2015 (poster).
  
  
  7. 杉村 佳織, 郡 宏
     "ゆらぐ周期パターンのロバスト性の機序解明：体節形成における分子時計の効果"
     CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域 第4回数理デザイン道場, 大阪ガス研修所奥池ロッジ(兵庫県芦屋市), 12 Jun., 2015 (poster).
  
  
  8. 杉村 佳織, 郡 宏
     "体節形成における振動の効果に関する理論研究"
     日本物理学会第70回年次大会, 早稲田大学早稲田キャンパス(東京都新宿区), 21 Mar., 2015 (poster).
  
  
  9. 杉村 佳織, 郡 宏
     "興奮性媒体のスパイラルカオスの統計的性質"
     京都大学シンポジウムRIMS研究集会, 京都大学(京都府京都市), 18 Sept., 2014 (oral:招待講演).
  
  
  10. 杉村 佳織, 郡 宏
      "Defect数の生成・消滅率に基づくスパイラルカオスの解析"
      日本物理学会秋季大会, 中部大学春日井キャンパス(愛知県春日井市), 9 Sept., 2014 (oral).
  
  
  11. 杉村 佳織, 郡 宏
      "興奮性媒体における時空カオスの転移現象と不整脈の関係"
      CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域 第2回デザイン道, IBM天城ホームステッド(静岡県伊豆市), 26 Jul., 2014 (poster).
  
  
  12. 杉村 佳織, 郡 宏
      "興奮場の遷移的時空カオスのシステムサイズの依存性"
      自己組織化討論会, 晴海グランドホテル(東京都中央区), 29 Jun., 2014 (oral).
  
  
  13. 杉村 佳織, 郡 宏
      "時空カオスの持続時間と不整脈"
      日本物理学会第69回年次大会, 東海大学湘南キャンパス(神奈川平塚市), 29 Mar., 2014 (oral).
  
  
  14. 杉村 佳織, 郡 宏
      "心房細動と興奮性媒質の時空カオス"
      時間生物学会サテライトシンポジウム 「生物リズム現象の数理フロンティア」, 近畿大学東大阪キャンパス(大阪府東大阪市), 11 Nov., 2013 (poster).
  
  
  15. 杉村 佳織, 郡 宏
      "2D拡散反応系におけるスパイラルカオスのシステムサイズ依存性"
      日本物理学会秋季大会, 徳島大学常三島キャンパス(徳島県徳島市), 28 Sept., 2013 (poster).
  
  
  16. 杉村 佳織, 郡 宏
      "興奮性媒体における時空カオスのシステムサイズ依存性"
      第23回日本数理生物学会大会, 静岡大学浜松キャンパス(静岡県浜松市), 11 Sept., 2013 (poster).
  
  

• Seminars

  1. 杉村 佳織, 郡 宏
     "位相縮約法を用いた細胞極性の秩序化現象の理論研究"
     水戸数学情報数理セミナー, 茨城大学水戸キャンパス(茨城県水戸市), 16 Nov., 2017 (oral).
  
  
  2. 杉村 佳織, 郡 宏
     "細胞集団の極性の秩序化現象：位相モデルの導出から細胞形状依存性の解析まで"
     　非線形ワークショップ, 東京工科大学八王子キャンパス(東京都八王子市), 29 July, 2017 (oral:招待講演).
  
  
  3. 杉村 佳織, 郡 宏
     "システムサイズ依存するスパイラルカオスのlifetimeの解析"
     千葉大学非線形科学セミナー, 千葉大学西千葉キャンパス(千葉県千葉市), 28 Jan., 2016 (oral).
  
  

• Lectures

  1. 「キャリア開発特論（ロールモデル編）」第12回講義,お茶の水女子大学(東京都文京区), 4 July, 2017.
  
  

• Awards

2017.11 保井・黒田奨学基金
2015.4-2017.3 お茶の水女子大学大学院博士後期課程研究奨励賞


• Education

  2009.4-2013.3 Department of Mathematics, Ochanomizu University (Bachelor student)
  Supervisor: Prof. Hideyuki Majima
  
  2013.4-2015.3 Department of Information Sciences, Ochanomizu University (Master Course student)
  Supervisor: Prof. Hiroshi Kori
  
  2015.4-present Department of Information Sciences, Ochanomizu University (Doctor Course student)
  Supervisor: Prof. Hiroshi Kori