Kaori Sugimura (杉村 佳織)
Ph.D. student (博士後期課程3年)
Ochanomizu University
Mail: sugimura.kaori(at)is.ocha.ac.jp
Research topics
- Nonlinear Dynamics
- Phase reduction of the model for planar cell polarity
- Spatio-temporal pattern formation
Publications
- Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
“A reduced cell-based phase model for tissue polarity alignment through global anisotropic cues”
Scientific Reports 7, 17466 (2017).
- Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
“A Simple Generic Model of Cellular Polarity Alignment: Derivation and Analysis” (2016).
[arXiv]
- Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
“Exponential system-size dependence of the lifetime of transient spiral chaos in excitable and oscillatory media”
Physical Review E 92, 062915 (2015). [arXiv]
- 杉村 佳織, 郡 宏
"線形安定性解析によるスパイラルカオスの性質区別とdefect検出の実装方法"
数理解析研究所講究録, No.1937, pp149-153 (2015)
International Conferences and Workshops
- Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
"Phase model for polarity ordering in spatially extended dynamical units: Derivation and dynamical properties"
5th Winter Q-BIO meeting
Grand Hyatt Kauai Resort and Spa, Kauai, Hawaii, 23 Feb., 2017 (poster).
- Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
"Phase model for polarity ordering in spatially extended dynamical units: Derivation and dynamical properties"
9th Dynamics Days Asia Pacific
Hong Kong Baptist University, Hong Kong University of Science and Technology, Kowloon Tong, Hong Kong, 15 Dec., 2016 (oral).
- Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
"Role of oscillation in periodic pattern formation in a noisy system"
8th International Conference Engineering of Chemical Complexity
IAS, Technische Universität München, Garching, München, Germany, 23 Jun., 2015 (poster).
- Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
"System size dependence of spiral chaos in excitable media: lifetime and transition rate"
International WE-Heraeus-Physics-School on Model systems for understanding biological processes,
Bad Honnef, Germany, 26 Feb., 2015 (oral).
- Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
"Exponential dependence of the lifetime of spiral chaos on system size"
The 10th AIMS conference on dynamical systems, Universidad Autonoma de Madrid, Spain, 9 Jul., 2014 (oral).
- Kaori Sugimura, Hiroshi Kori
"Lifetime of spatiotemporal chaos and the atrial fibrillation"
Spatiotemporal pattern formation in biological and active matters, Ochanomizu Univ., Tokyo, Japan, 2 Mar., 2013 (poster).
Domestic Conferences and Workshops (in Japanese)
- 杉村 佳織, 郡 宏, 石原 秀至, 杉村 薫
"実験データに基づく平面内細胞極性の細胞形状依存性の理論研究"
日本物理学会秋季大会, 岩手大学上田キャンパス(岩手県盛岡市), 23 Sept., 2017 (oral).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"平面内細胞極性のダイナミクスの幾何的情報依存性"
日本物理学会第72回年次大会, 大阪大学豊中キャンパス(大阪府豊中市), 17 Mar., 2017 (oral).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"平面内細胞極性のモデルの位相縮約理論"
日本物理学会秋季大会, 金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市), 14 Sept., 2016 (oral).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"平面内細胞極性を再現するモデルの位相縮約理論の構築"
CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域 第6回数理デザイン道場, 東レ(株)総合研修センター(静岡県三島市), 13 Jun., 2016 (poster).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"平面内細胞極性を示す数理モデルの構築"
日本物理学会第71回年次大会, 東北学院大学泉キャンパス(宮城県仙台市), 20 Mar., 2016 (poster).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"遷移的スパイラルカオスの持続時間のシステムサイズ依存性"
日本物理学会秋季大会, 関西大学千里山キャンパス(大阪府吹田市), 17 Sept., 2015 (poster).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"ゆらぐ周期パターンのロバスト性の機序解明:体節形成における分子時計の効果"
CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域 第4回数理デザイン道場, 大阪ガス研修所奥池ロッジ(兵庫県芦屋市), 12 Jun., 2015 (poster).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"体節形成における振動の効果に関する理論研究"
日本物理学会第70回年次大会, 早稲田大学早稲田キャンパス(東京都新宿区), 21 Mar., 2015 (poster).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"興奮性媒体のスパイラルカオスの統計的性質"
京都大学シンポジウムRIMS研究集会, 京都大学(京都府京都市), 18 Sept., 2014 (oral:招待講演).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"Defect数の生成・消滅率に基づくスパイラルカオスの解析"
日本物理学会秋季大会, 中部大学春日井キャンパス(愛知県春日井市), 9 Sept., 2014 (oral).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"興奮性媒体における時空カオスの転移現象と不整脈の関係"
CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域 第2回デザイン道, IBM天城ホームステッド(静岡県伊豆市), 26 Jul., 2014 (poster).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"興奮場の遷移的時空カオスのシステムサイズの依存性"
自己組織化討論会, 晴海グランドホテル(東京都中央区), 29 Jun., 2014 (oral).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"時空カオスの持続時間と不整脈"
日本物理学会第69回年次大会, 東海大学湘南キャンパス(神奈川平塚市), 29 Mar., 2014 (oral).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"心房細動と興奮性媒質の時空カオス"
時間生物学会サテライトシンポジウム 「生物リズム現象の数理フロンティア」, 近畿大学東大阪キャンパス(大阪府東大阪市), 11 Nov., 2013 (poster).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"2D拡散反応系におけるスパイラルカオスのシステムサイズ依存性"
日本物理学会秋季大会, 徳島大学常三島キャンパス(徳島県徳島市), 28 Sept., 2013 (poster).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"興奮性媒体における時空カオスのシステムサイズ依存性"
第23回日本数理生物学会大会, 静岡大学浜松キャンパス(静岡県浜松市), 11 Sept., 2013 (poster).
Seminars
- 杉村 佳織, 郡 宏
"位相縮約法を用いた細胞極性の秩序化現象の理論研究"
水戸数学情報数理セミナー, 茨城大学水戸キャンパス(茨城県水戸市), 16 Nov., 2017 (oral).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"細胞集団の極性の秩序化現象:位相モデルの導出から細胞形状依存性の解析まで"
非線形ワークショップ, 東京工科大学八王子キャンパス(東京都八王子市), 29 July, 2017 (oral:招待講演).
- 杉村 佳織, 郡 宏
"システムサイズ依存するスパイラルカオスのlifetimeの解析"
千葉大学非線形科学セミナー, 千葉大学西千葉キャンパス(千葉県千葉市), 28 Jan., 2016 (oral).
Lectures
-
「キャリア開発特論(ロールモデル編)」第12回講義,お茶の水女子大学(東京都文京区), 4 July, 2017.
Awards
2017.11 保井・黒田奨学基金
2015.4-2017.3 お茶の水女子大学大学院博士後期課程研究奨励賞
Education
2009.4-2013.3 Department of Mathematics, Ochanomizu University (Bachelor student)
Supervisor: Prof. Hideyuki Majima
2013.4-2015.3 Department of Information Sciences, Ochanomizu University (Master Course student)
Supervisor: Prof. Hiroshi Kori
2015.4-present Department of Information Sciences, Ochanomizu University (Doctor Course student)
Supervisor: Prof. Hiroshi Kori